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抗病抑虫效应 主要表现在3个方面：有些微生物肥料的菌种接种作物后，由于在作物根部大量生长繁殖形成优势种群，除了自身的作用外，还能抑制或减少病原微生物的繁殖机会，有的本身就有拮抗病原微生物的作用。建立良好的市场管理秩序，政管理部门必须加大登记管理和打击假冒伪劣产品的力度，创造良好的社会环境。要加强对生物肥料的质量监督，保证其生产质量，提高市场监督员的专业知识水平，阻止伪劣假冒生物肥料流入市场。
配方科学、养分齐全。生物有机复合肥料一般是以有机物质为主体，配合少量的化学肥料，按照农作物的需肥规律和肥料特性进行科学配比，与生物“活化剂”wm组合，除含有氮、磷、钾大量营养元素和钙、镁、硫、铁、硼、锌、硒、钼等中微量元素外，还含有大量有机物质、腐殖酸类物质和保肥增效剂，养分齐全，速缓相济，供肥均衡，肥效持久。
生物肥与化学农药的本质区别是，后者往往重在“治标”，出了问题才被动采取对策，而生物肥则是“标本兼治”，着重从根本上改善土壤生态环境，调整土壤微生物的种群结构，营造一个不利于发病而利于作物生长的土壤生态环境，寓治于防，达到“以正压邪”的目的其施用量一般不大，在其生产过程中所消耗的能量也很少，且施用生物肥料的同时还可减少化肥的施用量，因而节约了施肥成本。所以，生物肥料必须是在施足有机肥和适量化肥的基础上才能发挥出其增产效果，或者说生物肥料只能是作为辅助肥料，而不能替化肥和有机肥。